金剛杵由幾個部分組成。中央是一個球體，代表空性（Sunyata），即宇宙的原始本質和萬物的根本統一。從球體中延伸出兩朵八瓣蓮花。一朵代表現象界（或在佛教術語中稱為輪迴 Samsara），另一朵代表本體界（涅槃 Nirvana）。這是未悟者所感知的基本二分法。金剛杵的物理表現，這裡也稱為「多羅耶」（dorje），象徵男性生殖器。
 
在蓮花的邊緣上均勻地排列著兩隻、四隻或八隻被稱為「那伽」（makara）的生物。這些是半魚半鱷的神話生物，由兩種或多種動物組成，通常象徵著對立面的融合（或超越我們常見經驗的品質和諧）。從那伽的嘴中伸出來的舌頭會聚集成一個尖端。